科研實驗無小事——細胞的STR鑒定

做實驗的時候才發(fā)現(xiàn)細胞的種類太多，于是我們需要查詢各種文獻看每個細胞的特征，從而設(shè)計實驗規(guī)劃與步驟，我們在緊湊的實驗種完成了實驗，提交文章的時候，才發(fā)現(xiàn)，需要細胞鑒定。

據(jù)統(tǒng)計約30%細胞系被交叉污染或錯誤辨識,因使用了交叉污染或錯誤辨識的細胞而導(dǎo)致研究結(jié)論錯誤、結(jié)果不可重復(fù)、臨床細胞治療災(zāi)難性后果……這浪費大量時間、精力和金錢。因此NIH、ATCC等機構(gòu)多次發(fā)出呼吁，要求研究者對細胞進行鑒定，最近美媒報道1/6科學(xué)家在研究使用“假"細胞，2014年12月、2015年2月Science雜志分別發(fā)表文章專題闡述細胞交叉污染和錯誤辨識的嚴重性；2015年4月Nature通知：Nature旗下所有雜志將要求作者鑒定論文中所用細胞系；2015年6月即有報道稱一科學(xué)家因用錯細胞系，撤銷Nature論文。NIH、ATCC、Nature和Science等機構(gòu)對此多次發(fā)出呼吁,要求研究者對細胞進行鑒定，STR基因分型已被作為金標(biāo)準(zhǔn)應(yīng)用于細胞系鑒定,越來越多雜志開始要求投稿人提供細胞STR鑒定結(jié)果。

在2011年美國就已經(jīng)頒布了細胞STR鑒定國家標(biāo)準(zhǔn)（ANSI/ATCC ASN-0002-2011）。目前STR檢測已被廣泛應(yīng)用于親子鑒定、個體識別、細胞來源判定等方面。ATCC、DSMZ、JCRB等國際有名細胞庫已將STR基因分型列為細胞鑒定的金標(biāo)準(zhǔn)。

STR鑒定已經(jīng)成為了細胞株的“ID"能在科研界通行無阻，必須要有STR。那么動物源呢，因為建立的DNA條帶并不完善，目前只有小鼠的部分細胞可以提供STR。

STR鑒定描述：

利用熒光標(biāo)記擴增產(chǎn)物長度多態(tài)分析方法對細胞樣本進行9個/16個STR位點進行分型。設(shè)計PCR引物，組成2個PANEL用于擴增多態(tài)位點。位點的熒光標(biāo)記采用引物上標(biāo)記5’FAM熒光標(biāo)記。引物用在線Primer3 軟件設(shè)計。PCR產(chǎn)物稀釋后取少量與內(nèi)標(biāo)標(biāo)記混勻后直接上ABI 3130xl進行毛細管電泳，數(shù)據(jù)文件用GeneMapper4.0（Appliedbiosystems）來分析。

STR（Short Tandem Repeat，短串聯(lián)重復(fù)序列）是一類廣泛存在于真核生物基因組中的DNA串聯(lián)重復(fù)序列，由于其核心序列重復(fù)次數(shù)存在個體差異多態(tài)性，因此STR也被稱為細胞的DNA指紋。